上海海关学院是有2个校区的。

　　学校现有两个校区，分别是上海本部校区(上海浦东)、苏州分校区(苏州吴中)，两个校区占地面积都不大，在校生规模不到3000人，校内实行准军事化管理，是一所小而精、管理颇严的高校。上海海关学院是经教育部批准设立的具有高等学历教育招生资格的全日制普通高等学校,直属于中华人民共和国海关总署。

　　上海海关学院(Shanghai Customs College)是经教育部批准设立的具有高等学历教育招生资格的全日制普通高等学校，直属于中华人民共和国海关总署，为“服务国家特殊需求人才培养项目”——学士学位授予单位开展培养硕士专业学位研究生试点工作单位。首批入选上海高等学校一流本科建设引领计划、上海高等学校一流研究生教育引领计划。

　　中国海关高等教育起始于1908年清政府在北京建立税务学堂(后更名为税务专门学校，并迁址上海)，该学堂是世界上最早从事海关高等专业教育的学校之一;上海海关学院前身为1953年设立的上海海关学校;1980年经国务院批准，升格为上海海关专科学校;1996年更名为上海海关高等专科学校。2007年3月，教育部批准在上海海关高等专科学校的基础上设立上海海关学院。

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